BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB025H12SP1|AL428469
(887 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1591 1744 0.0
3x_Contig1722 100 9e-21
3x_Contig1693 100 9e-21
3x_Contig1226 100 9e-21
>3x_Contig1591
Length = 14045
Score = 1744 bits (880), Expect = 0.0
Identities = 887/888 (99%), Gaps = 1/888 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 aacgacctcaatagtggtgacagtagcgggag-atgaataatattaacaacaacaacaac 59
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12229 aacgacctcaatagtggtgacagtagcgggagcatgaataatattaacaacaacaacaac 12288
Query: 60 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaacgaaaacaaaactgataatatc 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12289 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaacgaaaacaaaactgataatatc 12348
Query: 120 aataaaaacagtaataatacttcttataatgacgataacgacggtaatgatactacgctt 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12349 aataaaaacagtaataatacttcttataatgacgataacgacggtaatgatactacgctt 12408
Query: 180 aatgacaccgggctgaataaacacaatacaactgttggcggaaccgacgaagactacaca 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12409 aatgacaccgggctgaataaacacaatacaactgttggcggaaccgacgaagactacaca 12468
Query: 240 gacgaaaacatgcaagtcgataactacgacgatgactacgaagcagattacgattacgac 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12469 gacgaaaacatgcaagtcgataactacgacgatgactacgaagcagattacgattacgac 12528
Query: 300 tacgactacaaagatgtagaagattctaattctcctccagacccgggtactgacgatttc 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12529 tacgactacaaagatgtagaagattctaattctcctccagacccgggtactgacgatttc 12588
Query: 360 ctaattcatcatgatgacaacgacttgatgtatgaacccaatagacatgtggattactta 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12589 ctaattcatcatgatgacaacgacttgatgtatgaacccaatagacatgtggattactta 12648
Query: 420 tctcataaatggaacgaaaacgaaatatctcagtcatggcgttatatcattttgaaaaag 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12649 tctcataaatggaacgaaaacgaaatatctcagtcatggcgttatatcattttgaaaaag 12708
Query: 480 aaacggaaggacacagatttaatcaatgctgcaaggttggaaaatgcttcctggagaact 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12709 aaacggaaggacacagatttaatcaatgctgcaaggttggaaaatgcttcctggagaact 12768
Query: 540 tggtcaaaggctagaaataatctgaaaactgtgaatccagaatctttgaactggtcaaag 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12769 tggtcaaaggctagaaataatctgaaaactgtgaatccagaatctttgaactggtcaaag 12828
Query: 600 gattctgatgtaacttggttatacggtccgattgtagtgggcgatcaaaataactcgacg 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12829 gattctgatgtaacttggttatacggtccgattgtagtgggcgatcaaaataactcgacg 12888
Query: 660 tcgtcatcaaagcccacttccaacgttgaaataggaaacaatcatgcggccaccatgggg 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12889 tcgtcatcaaagcccacttccaacgttgaaataggaaacaatcatgcggccaccatgggg 12948
Query: 720 tatggttccgatgatgaaaattcaaaaaggttgatccaaaagtctcagagtcccggtcct 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12949 tatggttccgatgatgaaaattcaaaaaggttgatccaaaagtctcagagtcccggtcct 13008
Query: 780 aaacctattctaaagaagagaactgttagtgaaattatcgaggaaaactccaaatggaga 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 13009 aaacctattctaaagaagagaactgttagtgaaattatcgaggaaaactccaaatggaga 13068
Query: 840 ttagatatagcaaggcagcacagaaagcaaactagtgacttgcatgct 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 13069 ttagatatagcaaggcagcacagaaagcaaactagtgacttgcatgct 13116
>3x_Contig1722
Length = 17718
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 9922 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 9975
>3x_Contig1693
Length = 15531
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 8879 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 8932
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 8882 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 8935
>3x_Contig1226
Length = 5066
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 4951 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 4898
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 4945 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 4892
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 4948 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 4895
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 45 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaac 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 4942 aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac 4889
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 9767
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 9767
Number of successful extensions: 1272
Number of sequences better than 1.0e-20: 4
length of query: 887
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 871
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 8997115569
effective search space used: 8997115569
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.6 bits)